院外機構向本院提出申請合作之公函，由受委託之計畫主持人及所屬單位，依現況與可行性進行評估後，專案簽陳，加會 技轉組、會計室及政風室等業管單位，陳院長核示後，得簽訂「合作意向書」，以做為雙方進一步合作計畫之基礎。

本院計畫主持人或創作發明人及所屬單位，為完成年度任務或因應未來研究發展目標，得檢陳單位需求及產官學合作可行性與預期效益等相關資料，專案簽陳，並加會 技轉組、會計室及政風室等業管單位後，陳院長核示。

經 院長核示「原則同意」之產官學合作計畫案，由計畫主持人或創作發明人及所屬單位負責、各業管單位配合與院外機構，進行研究計畫及契約合意，必要時得協請法律顧問或律師共同參與。專案陳核時，需檢附合約及計畫書等資料，經產官學委員會審查，若具臨床試驗之合作計畫，應送本院人體試驗委員會審查通過，再陳院長核定後，辦理諮詢顧問。